口袋妖怪火红原版当中无法在野外草丛捕捉妙蛙种子，唯一正规获取途径就是开局在真新镇大木博士的研究所内，从三只初始宝可梦当中挑选得到妙蛙种子作为开局伙伴。进入游戏走完开场剧情之后，角色离开自家房屋向道路北边前进，触发大木博士被野生宝可梦追赶的剧情，随后就会被带回研究所，此时桌面上摆放着三个精灵球，左侧精灵球内就是妙蛙种子，确认选择之后它就正式加入队伍，除此之外游戏地图所有野外草丛、洞穴、道路都不会刷新野生的妙蛙种子。
如果开局已经选择了小火龙或者杰尼龟，那么正常游玩的流程当中再也没有机会重新拿到妙蛙种子，游戏没有后期定点赠送、NPC交换获得妙蛙种子的隐藏任务，不少玩家误以为常磐森林可以抓到妙蛙种子，实际上这片区域只会刷新绿毛虫、独角虫、波波等宝可梦，并没有妙蛙种子的刷新点位，想要补齐御三家阵容，原版环境下只能依靠跨版本联机交换，将其他存档内的妙蛙种子传送过来，完成图鉴收集目标。联机交换时双方需要来到宝可梦中心二楼，进入联机房间之后完成宝可梦互换，交换得到的妙蛙种子可以正常升级进化，不会出现属性或者技能异常的问题。
选择妙蛙种子开局有着非常明显的实战优势，草加毒的双属性可以轻松通关前期尼比市岩石道馆与华蓝市水道馆，藤鞭技能能够打出高额的属性克制伤害，大幅减少前期对战消耗的药水资源，妙蛙种子16级进化成为妙蛙草，32级进化为妙蛙花，进化之后可以学会睡眠粉、寄生种子这类消耗型技能，在对战高血量BOSS或者野外刷怪时实用性很强。选定妙蛙种子之前可以先存档，反复重启刷取适合的性格，大胆、温和、内敛都是比较适配妙蛙花的性格词条，刷到满意的个体之后再正式开启冒险旅途，避免后期因为性格短板重新开档。
市面上部分改版修改了野生精灵分布，这类特殊版本当中妙蛙种子有可能出现在常磐森林、22号道路的草丛地带，这类点位属于改版专属设定，并不适用于原版游戏，在草丛寻找野生妙蛙种子时，建议将队伍首位放置等级偏低的宝可梦，使用喷雾道具降低高等级野怪的出现概率，准备足量的超级球、高级球，抓到之后第一时间前往宝可梦中心检查状态。原版玩家如果不想重新开档，也可以优先培养队伍当中其他草系宝可梦，比如喇叭芽、走路草，用来暂时替代妙蛙种子完成前期的关卡推进。
