超时空方舟的剧情从作为肉鸽属性的无限轮回开始入手，构建了一个完整的解释轮回的背景观。并且会随着玩家逐步深入，了解到世界的全貌。个人觉得如果你是纯牌佬，就冲着打牌去的，那本作肯定是值得一试。而如果你仅仅对游戏角色和世界观感兴趣，把它当做一个故事去体验剧情也是可行的。
游戏每回合并不是标准的严格区分敌我双方的设计，很多时候你跟怪物的行动是交替进行的，每个怪物的身下都有一个倒计时，表示多少个时间之后会行动攻击一次。且它要做什么、目标是谁，通常来说你是不知道的，可以说这个决定着最底层的战斗系统，跟杀戮尖塔已经是天差地别了。
那么时间如何来计数呢？玩家每使用一张牌就会获取一个时间，这就引发出了两种最基本的卡牌差别。普通和迅速，迅速卡使用之后敌人的计数器并不会减少，意思就是瞬间打出去了，而普通卡则需要消耗一个单位的时间。
相信新手看到这里肯定就会想，迅速卡就是比较高贵，卡组如果全拿迅速卡岂不是全部行动完，怪物才会开始行动。如果真的变成这样，这个系统设计就有问题了。之所以这样设计，最重要的目的就是增加玩家回合内跟怪物之间的互动性，避免卡组成型之后过于自闭减少策略。
既然敌人的计数器减少的主动权在玩家这里，那么这个系统必须要做到玩家可以通过控制敌我双方的行动顺序来获得战略上的优势。如何设计呢？这就关乎到体力值系统。不同于大部分卡牌肉鸽中的对血量的严格控制，本作专门设计了很多治疗系的角色。
它们拥有着可以让角色起死回生的各种加血卡牌，那加血跟上述所讲有关系吗？比如你目前有两费，已经用完了所有的攻击卡，只剩下治疗卡。此时怪物还有一单位时间才会攻击，而你没有人掉血，此时应该怎么做？总不可能对着满血的队员直接加血吧。
但如果回合结束，等怪物打完，你就需要花费额外的费用在下回合加血，这回合的两费就算浪费掉了。所以如果你可以让怪物先动，让它打完，然后把血奶回来，消耗掉费用再结束回合，就会很赚。这就是控制行动顺序的作用，除了可以使用普通卡去控制之外，还可以直接用等待这个技能。它每回合只有第一次是免费的，后面还需要花费额外的费用。
